易春华, 谢齐斌, 唐薇薇, 朱春刚, 秦长串, 伍和明, 韦达有. 2016: 猪嵴病毒VP1基因序列测定与分析. 南方农业学报, 47(4): 670-673. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.04.670
引用本文: 易春华, 谢齐斌, 唐薇薇, 朱春刚, 秦长串, 伍和明, 韦达有. 2016: 猪嵴病毒VP1基因序列测定与分析. 南方农业学报, 47(4): 670-673. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.04.670
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YI Chun-hua, XIE Qi-bin, TANG Wei-wei, ZHU Chun-gang, QIN Chang-chuan, WU He-ming, WEI Da-you. 2016: Sequenceing and analysis of VP1 gene of procine kobuvirus. Journal of Southern Agriculture, 47(4): 670-673. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.04.670
Citation: YI Chun-hua, XIE Qi-bin, TANG Wei-wei, ZHU Chun-gang, QIN Chang-chuan, WU He-ming, WEI Da-you. 2016: Sequenceing and analysis of VP1 gene of procine kobuvirus. Journal of Southern Agriculture, 47(4): 670-673. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.04.670
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猪嵴病毒VP1基因序列测定与分析

Sequenceing and analysis of VP1 gene of procine kobuvirus

    摘要
  • 摘要: 目的对猪嵴病毒(PKV) VP1基因进行测序与同源性分析,确认其可能来源,为今后的生物学特性分析及仔猪腹泻防治工作提供科学依据.方法采用RT-PCR对GXPKV-1毒株VP1基因进行克隆,运用DNASTAR软件包中Megalign程序对测序获得的VP1基因进行核苷酸序列及其推导氨基酸序列同源性分析.结果GXPKV-1毒株ⅥP1基因全长762 bp,共编码254个氨基酸,与GenBank已公布的13株参考毒株VP1基因的核苷酸同源性为74.1%~85.4%,推导氨基酸同源性为81.1%~93.3%.根据VP1基因推导氨基酸序列进行系统发育进化分析,发现GXPKV-1毒株与Gansu-2012、JS1419等国内参考毒株同属于同一亚群,而与瑞士分离株Swine-S-1-2007、泰国分离株THA-2008、美国分离株H24-2012-USA及四川分离株CHN-SC-2011-02等的亲缘关系较远.结论猪嵴病毒GXPKV-1毒株起源于国内流行毒株的传播,在新的环境下虽然其VP1基因核苷酸发生变异,但由于同义翻译,推导氨基酸的同源性仍然较高,说明碱基突变并未引起蛋白结构的改变.

     

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