摘要:
目的解析鹅圆环病毒(Goose Circovirus,GoCV)广西流行毒株的全基因组序列及其遗传进化地位,掌握广西GoCV的流行情况,为今后更有效防控GoCV提供理论依据.方法分3段对阳性组织样品中的GoCV全基因组进行PCR扩增、克隆和测序,并对拼接得到的GoCV广西流行毒株全基因组进行核苷酸组成、基因组结构及遗传变异分析.结果GoCV广西流行毒株(GXTD254)全基因组长度为1822 nt,编码4个主要开放阅读框:ORFV1(Rep蛋白,293个氨基酸)、ORF V2(37个氨基酸)、ORF C1(Cap蛋白,250个氨基酸)和ORF C2(99个氨基酸),且Rep蛋白较Cap蛋白相对保守.遗传进化分析结果表明,GXTD254毒株与4株浙江永康分离毒株(ZJyk1、ZJyk2、ZJyk3和ZJyk4)、1株浙江象山分离毒株(ZJxs1)的遗传距离最接近,同属于一个遗传分支,但与我国台湾的大多数分离毒株(TW1021024G、TWGB21-9、TW6、TW9、TW8和TW1020111GB)及另外2株浙江象山分离毒株(ZJxs3和ZJxs5)的遗传距离较远.结论目前我国流行的GoCV存在多个分支,广西流行毒株与部分浙江分离毒株在亲缘关系上比较接近.
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