王超霞, 张雅丽, 卢江. 2016: 葡萄芪合酶基因家族上游调控序列分析. 南方农业学报, 47(1): 1-6. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.01.1
引用本文: 王超霞, 张雅丽, 卢江. 2016: 葡萄芪合酶基因家族上游调控序列分析. 南方农业学报, 47(1): 1-6. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.01.1
WANG Chao-xia, ZHANG Ya-li, LU Jiang. 2016: Analysis on upstream regulatory sequence of grape stilbene synthase gene family. Journal of Southern Agriculture, 47(1): 1-6. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.01.1
Citation: WANG Chao-xia, ZHANG Ya-li, LU Jiang. 2016: Analysis on upstream regulatory sequence of grape stilbene synthase gene family. Journal of Southern Agriculture, 47(1): 1-6. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.01.1

葡萄芪合酶基因家族上游调控序列分析

Analysis on upstream regulatory sequence of grape stilbene synthase gene family

  • 摘要: 目的通过预测葡萄芪合酶(Stilbene synthase,STS)基因上游调控序列的顺式作用元件及分析不同STS基因上游调控序列,为进一步揭示STS基因在葡萄生长发育及胁迫应答过程中的作用提供理论依据.方法通过PlantCARE数据库,在线对欧洲种葡萄PN40024全基因组里的48条STS基因上游调控序列及目前已报道来自其他葡萄品种(圆叶葡萄Noble、华东葡萄白河35-1和欧亚种葡萄无核白、红地球、赤霞珠等)的8条ST基因启动子序列进行顺式作用元件分析.结果STS基因上游调控区域含有多种顺式作用元件,可以分为过程特异元件、诱导子特异元件、结合位点特异元件、环境特异元件、植物组织特异元件、调控特异元件、光响应元件及转录相关元件八大类,其中与抗病相关且出现次数较多的元件有TCA-element、ABRE、ERF、P-box、Box-W1、TC-rich repeats等.STS基因上游调控序列中含有数量不同的作用元件,其中欧亚种佳丽酿VvPinSTS26上游调控序列含有的顺式作用元件数量最多(49个),而VvPinSTS24上游调控序列含有的顺式作用元件数量最少(2个).结论葡萄ST基因家族大部分成员的表达受水杨酸、脱落酸、赤霉素、乙烯、真菌诱导子等因素影响,从而调节白藜芦醇参与葡萄生物胁迫或非生物胁迫的防御过程.

     

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