基于AMEL基因位点差异的水牛性别PCR鉴别方法

Sex identification of buffalos based on difference in AMEL gene loci by using PCR technique

摘要: 目的建立检测不同性别水牛染色体AMEL基因位点差异的PCR鉴别方法,为水牛早期胚胎性别鉴定及水牛分离精子重分析提供简便可靠的检验手段.方法采用PCR扩增不同性别水牛染色体中的AMEL基因,CloneManager 9.0软件分析序列差异,BLASTn程序分析基因同源性,MEGA 6.06软件构建系统发育进化树.结果以水牛血液基因组DNA为模板、amelB1为引物,引物退火温度60℃,公水牛可扩增出两条清晰条带,长度分别为376(AMEL-X基因)和304 bp(AMEL-Y基因);母水牛仅扩增出1条清晰条带,长度为376 bp(AMEL-X基因).与AMEL-X基因相比,水牛AMEL-Y基因缺失155~226区域的72 bp,同时存在20个基因型多态位点.临床检测结果证实,基于AMEL基因的PCR鉴别结果与实际性别的吻合率达100%,amelB1引物的灵敏度为0.5 ng模板量.BLASTn比对分析结果显示,水牛AMEL-X和AMEL-Y基因与不同哺乳动物的对应序列存在高度保守性,其相似性均接近或高于90%,与牛存在最近的亲缘关系.结论AMEL基因在哺乳动物中高度保守,且在不同性别水牛中呈多态性特征,以其作为分子靶标建立的水牛性别PCR鉴定方法切实可行,为水牛早期胚胎性别鉴定及水牛分离精子重分析提供了一个更便捷、高效的检验手段.