陆川猪热休克蛋白90基因的克隆与序列分析

Gene cloning and sequence analysis of heat shock protein 90 in Luchuan pig

摘要: 目的对陆川猪热休克蛋白90 (HSP90)基因进行克隆与序列分析,为研究HSP90与陆川猪抗热应激的相关性及寻找猪耐热性分子标记奠定基础.方法根据GenBank已发表的猪HSP90基因序列(登录号NM 213973.1)设计引物,RT-PCR扩增HSP90基因编码区序列,并应用LaserGene、MegAlign等生物软件进行序列分析及蛋白质结构预测.结果克隆获得陆川猪HSP90基因编码区序列长2202 bp,编码733个氨基酸,分子质量84774.8 U,理论等电点4.93;与野猪的亲缘关系最近,其氨基酸同源性为100.0%,与牛、绵羊、人类、大猩猩的氨基酸同源性也在96.2%以上.陆川猪HSP90蛋白N端有1个HATPase_c superfamily保守结构域,C端最末端有一个MEEVD保守序列,氨基酸序列中存在5个HSP90家族特有保守信号区,其成熟肽包含有α螺旋、β转角、延长线和无规卷曲4种二级结构元件.结论猪HSP90基因高度保守,可作为研究陆川猪抗热应激的候选基因之一.