陆坚, 杜丽琴, 庞浩, 马贵, 韦宇拓, 黄日波. 2014: 温泉土壤宏基因组文库构建及普鲁兰酶筛选. 南方农业学报, 45(5): 725-730. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2014.5.725
引用本文: 陆坚, 杜丽琴, 庞浩, 马贵, 韦宇拓, 黄日波. 2014: 温泉土壤宏基因组文库构建及普鲁兰酶筛选. 南方农业学报, 45(5): 725-730. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2014.5.725
LU Jian, DU Li-qin, PANG Hao, MA Gui, WEI Yu-tuo, HUANG Ri-bo. 2014: Construction of a metagenomic library from hot spring soil and cloning of pullulanase gene. Journal of Southern Agriculture, 45(5): 725-730. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2014.5.725
Citation: LU Jian, DU Li-qin, PANG Hao, MA Gui, WEI Yu-tuo, HUANG Ri-bo. 2014: Construction of a metagenomic library from hot spring soil and cloning of pullulanase gene. Journal of Southern Agriculture, 45(5): 725-730. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2014.5.725

温泉土壤宏基因组文库构建及普鲁兰酶筛选

Construction of a metagenomic library from hot spring soil and cloning of pullulanase gene

  • 摘要: 目的构建温泉土壤宏基因组文库并进行普鲁兰酶活性筛选,以期获得高活力、耐高温的新型普鲁兰酶基因.方法采用间接法提取温泉土壤样品中宏基因组DNA,经Sephadex G200(含2% PVPP)凝胶柱和电洗脱两步纯化后,扩增16S rRNA序列,通过序列比对和系统发育进化树分析温泉土壤微生物的多样性;然后以pCC1FOS为载体构建温泉土壤宏基因组文库,并对所获得的宏基因组文库进行活性筛选.结果利用宏基因组技术提取温泉土壤样品中微生物的基因组DNA,构建了一个约含1 146个克隆的温泉土壤16S rRNA文库,经遗传进化分析,发现温泉土壤样品中的大部分微生物未被研究过,主要来源于厚壁菌门(Firmicutes),其次为恐球菌—栖热菌门(Deinococcus-Thermus)和变形杆菌门(Proteobacteria).用提取获得的宏基因组DNA成功构建了温泉土壤微生物宏基因组Fosmid文库,文库约含2.7万个克隆,平均插入片段长度为40.0 kb,文库外源DNA总容量为1.2×109bp;通过活性筛选共获得9个可表达普鲁兰酶活性的克隆.结论宏基因组文库技术是获取极端环境微生物新酶的有效手段,可为进一步挖掘普鲁兰酶的应用潜力及研究其耐热机理奠定基础.

     

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