任春梅, 程兆榜, 缪倩, 魏利辉, 周益军, 范永坚. 2013: 江苏省葫芦科作物西瓜花叶病毒的分子鉴定和序列分析. 南方农业学报, 44(9): 1464-1470. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.9.1464
引用本文: 任春梅, 程兆榜, 缪倩, 魏利辉, 周益军, 范永坚. 2013: 江苏省葫芦科作物西瓜花叶病毒的分子鉴定和序列分析. 南方农业学报, 44(9): 1464-1470. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.9.1464
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REN Chun-mei, CHENG Zhao-bang, MIAO Qian, WEI Li-hui, ZHOU Yi-jun, FAN Yong-jian. 2013: Molecular identification and sequence analysis for watermelon mosaic virus in Jiangsu. Journal of Southern Agriculture, 44(9): 1464-1470. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.9.1464
Citation: REN Chun-mei, CHENG Zhao-bang, MIAO Qian, WEI Li-hui, ZHOU Yi-jun, FAN Yong-jian. 2013: Molecular identification and sequence analysis for watermelon mosaic virus in Jiangsu. Journal of Southern Agriculture, 44(9): 1464-1470. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.9.1464
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江苏省葫芦科作物西瓜花叶病毒的分子鉴定和序列分析

Molecular identification and sequence analysis for watermelon mosaic virus in Jiangsu

    摘要
  • 摘要: 目的对江苏各地具典型褪绿花叶症状的多种葫芦科作物是否为西瓜花叶病毒(Watermelon mosaic virus,WMV)侵染进行分子鉴定,明确该病毒在江苏的遗传分化.方法提取样品总RNA,利用西瓜花叶病毒的cp基因特异性引物进行RT-PCR扩增,克隆测序,应用DNASTAR和Clustal X软件进行序列分析.结果来自南瓜、瓠瓜、西瓜和西葫芦的11个分离物的RNA模板中均检测到1200 bp左右的片段;序列测定表明该片段含1154个核苷酸,包含完整的编码281个氨基酸的WMV-cp基因.序列比对结果表明,11个分离物和来自不同地区的17个分离物WMV-cp基因核苷酸和推导的编码CP蛋白氨基酸序列同源性分别为90.5%~100.0%和92.9%~100.0%.结论WMV的遗传变异与地缘相关性较强而与寄主相关性较弱.江苏分离物WMV-CP氨基酸均具有蚜传株系的特征结构域DAG,暗示其田间流行与蚜虫有关.

     

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