任昆, 白俊杰, 樊佳佳, 全迎春, 于凌云. 2013: 草鱼的微卫星亲权鉴定. 南方农业学报, 44(8): 1367-1371. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.8.1367
引用本文: 任昆, 白俊杰, 樊佳佳, 全迎春, 于凌云. 2013: 草鱼的微卫星亲权鉴定. 南方农业学报, 44(8): 1367-1371. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.8.1367
REN Kun, BAI Jun-jie, FAN Jia-jia, QUAN Ying-chun, YU Ling-yun. 2013: Parentage identification of grass carp (Ctenopharyngodon idella)using micro-satellites. Journal of Southern Agriculture, 44(8): 1367-1371. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.8.1367
Citation: REN Kun, BAI Jun-jie, FAN Jia-jia, QUAN Ying-chun, YU Ling-yun. 2013: Parentage identification of grass carp (Ctenopharyngodon idella)using micro-satellites. Journal of Southern Agriculture, 44(8): 1367-1371. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.8.1367

草鱼的微卫星亲权鉴定

Parentage identification of grass carp (Ctenopharyngodon idella)using micro-satellites

  • 摘要: 目的从亲权排除率、鉴别准确率、鉴别成功率等方面评价微卫星标记鉴别草鱼亲权关系的可行性,为草鱼系谱信息的确定奠定基础.方法利用8个微卫星标记检测5个草鱼家系亲本(F.)及其子代(F1)的基因型,以Cervus 3.0软件进行亲权鉴定,并统计微卫星位点的等位基因数(Na)、多态信息含量(PIC)、观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)等;最后通过模拟分析和试验验证,评估8个微卫星位点最多可鉴定的亲本数及其与鉴定率、置信度之间的关系.结果8个微卫星位点中,当两个亲本基因型未知时,单个亲本排除率(E-1P)介于0.342~0.668,平均值为0.520;当一个亲本基因型已知时,另一个亲本的排除率(E-2P)介于0.521~0.802,平均值为0.681;一对亲本组合的亲权排除率(E-PP)介于0.711~0.937,平均值为0.847.以95%置信水平和100%鉴定率为标准,模拟分析及试验验证结果表明,所选择的8个微卫星位点最多可以鉴定598个已知性别的亲本或431个未知性别的亲本.结论所选的Hl18、H137、H165、H148、4703、C2489、H57、H81等8对微卫星标记可在生产及科研试验中用于获取草鱼系谱信息.

     

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