罗炼芳, 孔冉, 苏俊波. 2013: 甘蔗14-3-3基因克隆及表达分析. 南方农业学报, 44(11): 1757-1764. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.11.1757
引用本文: 罗炼芳, 孔冉, 苏俊波. 2013: 甘蔗14-3-3基因克隆及表达分析. 南方农业学报, 44(11): 1757-1764. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.11.1757
LUO Lian-fang, KONG Ran, SU Jun-bo. 2013: Cloning and expression analysis of 14-3-3 gene from Saccharum spp.hybrids. Journal of Southern Agriculture, 44(11): 1757-1764. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.11.1757
Citation: LUO Lian-fang, KONG Ran, SU Jun-bo. 2013: Cloning and expression analysis of 14-3-3 gene from Saccharum spp.hybrids. Journal of Southern Agriculture, 44(11): 1757-1764. DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.11.1757

甘蔗14-3-3基因克隆及表达分析

Cloning and expression analysis of 14-3-3 gene from Saccharum spp.hybrids

  • 摘要: 目的克隆甘蔗14-3-3基因并预测分析其编码蛋白的结构,为研究甘蔗基因功能和代谢调控机制提供参考.方法以水稻14-3-3基因为模板,BLAST甘蔗EST数据库,依据序列拼接结果及RT-PCR技术获得编码甘蔗14-3-3蛋白的全长基因,并用生物信息学方法对该蛋白的二级、高级结构和功能活性位点进行预测.结果克隆得到长784bp的甘蔗14-3-3基因,最大开放阅读框为771 bp,编码256个氨基酸;该蛋白的分子量与理论等电点分别为28.88 kDa和4.79.蛋白聚类分析结果表明,甘蔗14-3-3蛋白与水稻、高粱、玉米14-3-3蛋白的同源性均在90%以上.Cn3D V.4.1预测位于第3和第5两个二聚体上的Lys-50、Arg-57、Arg-131和Try-132组成一个凹穴,是结合靶蛋白的作用面;第60、65、188、218位的4个丝氨酸是磷酸化的活性位点.实时定量PCR检测结果表明,14-3-3基因在甘蔗不同组织中均有表达,在茎和分生组织中14-3-3基因高丰度表达,可能与糖代谢和细胞分裂的调控相关;而在根中可能参与矿物元素的吸收和代谢.结论甘蔗14-3-3基因可作为信号转导调控蛋白的候选基因之一.

     

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