谢小燕, 苏晓娜, 王惠梅, 江绍琳, 吴建利, 江绍玫. 2019: 基于两种电泳检测方法的华东野生菰ISSR遗传多样性分析. 南方农业学报, 50(12): 2638-2646. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.12.03
引用本文: 谢小燕, 苏晓娜, 王惠梅, 江绍琳, 吴建利, 江绍玫. 2019: 基于两种电泳检测方法的华东野生菰ISSR遗传多样性分析. 南方农业学报, 50(12): 2638-2646. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.12.03
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XIE Xiao-yan, SU Xiao-na, WANG Hui-mei, JIANG Shao-lin, WU Jian-li, JIANG Shao-mei. 2019: Genetic diversity analysis of Zizania latifolia by ISSR in East China based on two electrophoresis detection methods. Journal of Southern Agriculture, 50(12): 2638-2646. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.12.03
Citation: XIE Xiao-yan, SU Xiao-na, WANG Hui-mei, JIANG Shao-lin, WU Jian-li, JIANG Shao-mei. 2019: Genetic diversity analysis of Zizania latifolia by ISSR in East China based on two electrophoresis detection methods. Journal of Southern Agriculture, 50(12): 2638-2646. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.12.03
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基于两种电泳检测方法的华东野生菰ISSR遗传多样性分析

Genetic diversity analysis of Zizania latifolia by ISSR in East China based on two electrophoresis detection methods

    摘要
  • 摘要: 目的筛选更优的ISSR-PCR扩增产物电泳检测方法,分析我国华东地区野生菰种质资源遗传多样性,为建立和完善菰植物种质库及合理开发与利用菰资源提供理论依据.方法挑选7条ISSR引物对华东地区9个野生菰居群104份材料基因组DNA进行PCR扩增,其ISSR-PCR产物分别采用2%琼脂糖凝胶电泳和5%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测.结果2%琼脂糖凝胶电泳检测结果显示,华东地区野生菰的多态性位点百分率(PPB)为63.49%、观测等位基因数(Na)为1.6349、有效等位基因数(Ne)为1.3012、Nei's基因多样性指数(He)为0.1871、Shannon's信息指数(I)为0.2908、居群间遗传分化系数(Gst)为0.3922、遗传相似系数(Gs)变化范围在0.8293~0.9775;其聚类分析结果表明,当遗传相似性系数阈值为0.885时,9个野生菰居群被分为两大类,SH(上海)和PYH(鄱阳湖)居群归为一类,其他7个居群归为另一类.5%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果显示,华东地区野生菰的PPB为78.03%、Na为1.7803、Ne为1.2762、He为0.1804、I为0.2914、Gst为0.5086、Gs变化范围在0.7679~0.9837;其聚类分析结果表明,当遗传相似性系数阈值为0.850时,9个居群也被分为两大类,其中PYH居群单独为一类,其他8个居群归为另一类.结论我国华东地区野生菰种质资源遗传多样性丰富,居群间和居群内变异显著,基于ISSR分子标记的野生菰遗传多样性采用5%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳进行检测可获得更可靠的遗传图谱,而2%琼脂糖凝胶电泳检测更适合早期的ISSR分子标记引物筛选.

     

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