盛小伟, 高永华, 彭金霞, 李咏梅, 陈晓汉, 熊建华. 2011: 凡纳滨对虾类泛素折叠修饰蛋白Ufm1基因克隆、序列分析及结构预测. 南方农业学报, 42(2): 192-196. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2011.02.021
引用本文: 盛小伟, 高永华, 彭金霞, 李咏梅, 陈晓汉, 熊建华. 2011: 凡纳滨对虾类泛素折叠修饰蛋白Ufm1基因克隆、序列分析及结构预测. 南方农业学报, 42(2): 192-196. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2011.02.021
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SHENG Xiao-wei, GAO Yong-hua, PENG Jin-xia, LI Yong-mei, CHEN Xiao-han, XIONG Jian-hua. 2011: Cloning and sequencing of ubiquitin-fold modifier 1(Ufm1) gene and its structure prediction in Litopenaeus vannamei. Journal of Southern Agriculture, 42(2): 192-196. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2011.02.021
Citation: SHENG Xiao-wei, GAO Yong-hua, PENG Jin-xia, LI Yong-mei, CHEN Xiao-han, XIONG Jian-hua. 2011: Cloning and sequencing of ubiquitin-fold modifier 1(Ufm1) gene and its structure prediction in Litopenaeus vannamei. Journal of Southern Agriculture, 42(2): 192-196. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2011.02.021
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凡纳滨对虾类泛素折叠修饰蛋白Ufm1基因克隆、序列分析及结构预测

Cloning and sequencing of ubiquitin-fold modifier 1(Ufm1) gene and its structure prediction in Litopenaeus vannamei

    摘要
  • 摘要: 目的了解类泛素折叠修饰蛋白(Ufm1)的结构特征和蛋白功能,为进一步探究Ufm1基因功能提供参考.方法以同一生长性状分离凡纳滨对虾家系的肌肉组织为材料,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,通过斑点杂交筛选获得Ufm1基因,经全长cDNA文库筛选获得Ufm1基因全长序列.结果Ufm1基因全长cDNA序列长714 bp,包含261 bp的开放阅读框,推测编码的蛋白质为86个氨基酸,预测的分子量为9.3 ku,等电点pI为6.55;其编码蛋白无信号肽,无跨膜区域,可能定位于细胞质中,属于亲水性蛋白,含有1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、1个N-糖基化位点、2个蛋白激酶C磷酸化位点;序列同源性分析表明,不同进化地位物种的Ufm1基因存在较高的同源性.结论Ufm1基因在系统进化上高度保守,这为进一步探究Ufm1基因功能及原核表达等奠定了基础.

     

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