粗皮桉种源遗传多样性SSR分析

Analysis on genetic diversity of Eucalyptus pellita based on SSR markers

  • 摘要: 目的分析粗皮桉的亲缘关系及遗传多样性,为其种质资源利用及分子育种提供参考.方法以粗皮桉7个种源(种源1~7)75株样品为材料,基于覆盖巨桉全基因组的21个SSR标记,利用SSR位点、种源遗传分化及种源间遗传距离等分析粗皮桉群体遗传多样性.结果21对引物共扩增出252个等位基因(平均每个SSR引物扩增出12个),平均有效等位基因数(Ne)为4.5788,平均期望杂合度(HE)为0.7227,平均基因多样性(H)为0.7179,平均Shannon信息指数(I)为1.7150.7个种源的遗传多样性参数存在差异,其中种源3的遗传多样性参数最高.群体间的基因分化系数(FST)为0.0965,即9.65%的遗传变异存在于种源间,90.35%存在种源内.7个种源的遗传距离变化范围为0.0965~0.3188,平均为0.2061,聚类分析结果表明,当阀值为0.82时,7个种源被分为昆士兰北部种源和巴布亚新几内亚种源两大类;当阀值为0.84时,昆士兰北部的4个种源被进一步分为两大亚类,种源间遗传距离与种源的地理分布密切相关.结论粗皮桉7个种源存在较丰富的遗传多样性,适于开展长周期、多世代改良工作.

     

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