摘要: 目的研究芒果基因组SSR的总体特征,开发芒果SSR标记,为SSR标记在芒果种质资源鉴定、品种选育及遗传连锁图谱构建奠定基础.方法利用新一代454 GSFLX高通量测序技术结合SSR文库构建法,得到19611条无冗余的序列,对其进行SSR搜索,共获得8831条SSR.利用Primer 5.0软件设计SSR引物,并以筛选的引物对24份芒果种质进行多样性分析.结果在芒果SSR中,二核苷酸(5980个SSR)和三核苷酸(2451个SSR)占主导地位,所占比例分别为67.85%和27.81%;出现频率最高的二核苷酸重复基元是AC/GT,占总数的17.94%,出现最高的三核苷酸重复基元为TTC/GAA,占5.07%.随机选择50个SSR位点合成引物,经24份芒果种质筛选鉴定,21对引物可扩增获得产物,有效扩增率为42.00%;其中17对引物表现出良好多态性,占有效引物的80.95%,占总引物的34.00%.在17对多态性引物中,每对引物扩增等位基因数2~12个,产生的多态性片段为2~7个,多态性比例为50%~100%.结论454 GSFLX高通量测序开发SSR引物有较好的实用性,开发获得的17个具有多态性的芒果SSR标记可用于研究芒果及其相关近缘物种的遗传变异.