椰子种质资源遗传多样性的SSR分析

周丽霞, 曹红星

周丽霞, 曹红星. 2018: 椰子种质资源遗传多样性的SSR分析. 南方农业学报, 49(9): 1683-1690. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2018.09.01
引用本文: 周丽霞, 曹红星. 2018: 椰子种质资源遗传多样性的SSR分析. 南方农业学报, 49(9): 1683-1690. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2018.09.01
ZHOU Li-xia, CAO Hong-xing. 2018: SSR analysis on genetic diversity in coconut germplasm resource. Journal of Southern Agriculture, 49(9): 1683-1690. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2018.09.01
Citation: ZHOU Li-xia, CAO Hong-xing. 2018: SSR analysis on genetic diversity in coconut germplasm resource. Journal of Southern Agriculture, 49(9): 1683-1690. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2018.09.01

椰子种质资源遗传多样性的SSR分析

详细信息
  • 中图分类号: 45-1381/S

SSR analysis on genetic diversity in coconut germplasm resource

  • 摘要: [目的]研究椰子种质资源的遗传多样性,为椰子育种材料的选择及遗传改良提供理论依据.[方法]从100对SSR引物中筛选出多态性引物,并利用其分析26份椰子种质材料的有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Nei's基因多样性指数(H)、Shannon多态性信息指数(I)、多态信息含量(PIC)、多态性百分率(P)及遗传距离,并基于遗传距离对其进行聚类分析,以明确该椰子种质资源的遗传多样性及亲缘关系.[结果]筛选出的31对多态性SSR引物可扩增105个等位基因,平均每对引物扩增3.4个,各引物P为30.77%~84.62%,平均为63.28%;PIC为0.1596~0.8015,平均为0.4958.26份椰子种质材料中,马哇、小黄椰和越南红椰子的I、H和P均最高,分别为0.5501、0.3711和38.71%,云南-海74的I、H和P最低,分别0.2095、0.1583和19.35%.云南34021与云南34007的遗传距离最小,为0.206,三亚红椰-3与云南34024的遗传距离最大,为1.513.聚类分析结果表明,当遗传距离为0.670时,26份椰子种质被分为两大类,其中马哇和越南高种归为一类,剩余24份椰子种质归为另一类;当遗传距离为0.550时,26份椰子种质被分为四大类,即红矮、越南马可波罗、马哇和越南高种分别自成一类,其余22份归为一类.[结论]26份椰子种质的遗传多态性丰富,物种间亲缘关系较远,可为椰子遗传育种提供亲本材料.
  • 期刊类型引用(6)

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    3. 孙程旭,张芮宁,曹红星,张军. 甜水椰子株系选育的初步研究. 中国南方果树. 2022(04): 78-83+89 . 百度学术
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    5. 何畅,杨锦昌,余纽,刘振湘,覃国铭,陈朝黎. 基于油楠(Sindora glabra)转录组测序的SSR分子标记的开发. 分子植物育种. 2020(07): 2280-2289 . 百度学术
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  • 刊出日期:  2018-09-29

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