SSR analysis on genetic diversity in coconut germplasm resource
-
摘要: [目的]研究椰子种质资源的遗传多样性,为椰子育种材料的选择及遗传改良提供理论依据.[方法]从100对SSR引物中筛选出多态性引物,并利用其分析26份椰子种质材料的有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Nei's基因多样性指数(H)、Shannon多态性信息指数(I)、多态信息含量(PIC)、多态性百分率(P)及遗传距离,并基于遗传距离对其进行聚类分析,以明确该椰子种质资源的遗传多样性及亲缘关系.[结果]筛选出的31对多态性SSR引物可扩增105个等位基因,平均每对引物扩增3.4个,各引物P为30.77%~84.62%,平均为63.28%;PIC为0.1596~0.8015,平均为0.4958.26份椰子种质材料中,马哇、小黄椰和越南红椰子的I、H和P均最高,分别为0.5501、0.3711和38.71%,云南-海74的I、H和P最低,分别0.2095、0.1583和19.35%.云南34021与云南34007的遗传距离最小,为0.206,三亚红椰-3与云南34024的遗传距离最大,为1.513.聚类分析结果表明,当遗传距离为0.670时,26份椰子种质被分为两大类,其中马哇和越南高种归为一类,剩余24份椰子种质归为另一类;当遗传距离为0.550时,26份椰子种质被分为四大类,即红矮、越南马可波罗、马哇和越南高种分别自成一类,其余22份归为一类.[结论]26份椰子种质的遗传多态性丰富,物种间亲缘关系较远,可为椰子遗传育种提供亲本材料.
-
-
期刊类型引用(6)
1. 孙熹微,周丽霞,李静,弓淑芳,杨耀东. 香水椰子香味物质2-乙酰-1-吡咯啉(2AP)的研究进展. 分子植物育种. 2023(23): 7759-7766 . 百度学术
2. 刘景,丁健,韩平,王雪萍. 高通量RNA-seq技术开发巴旦木目的基因SSR标记. 东北农业科学. 2022(02): 42-47 . 百度学术
3. 孙程旭,张芮宁,曹红星,张军. 甜水椰子株系选育的初步研究. 中国南方果树. 2022(04): 78-83+89 . 百度学术
4. 毛跃雄,陆跃堂,胡志姣,赵杨. 基于SRAP分子标记的贵州省棕榈种质资源遗传多样性分析. 南方农业学报. 2020(01): 27-35 . 本站查看
5. 何畅,杨锦昌,余纽,刘振湘,覃国铭,陈朝黎. 基于油楠(Sindora glabra)转录组测序的SSR分子标记的开发. 分子植物育种. 2020(07): 2280-2289 . 百度学术
6. 陈加利,严武平,杨立荣,李栋梁,陈宣,郑道君. 海南桑树种质资源SSR标记的遗传多样性分析. 分子植物育种. 2019(22): 7594-7600 . 百度学术
其他类型引用(3)
计量
- 文章访问数: 15
- HTML全文浏览量: 1
- PDF下载量: 1
- 被引次数: 9