甘蔗乙烯受体基因Sc-ERS的克隆与序列分析
Cloning and sequencing of sugarcane ethylene receptor gene(Sc-ERS)
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摘要: 根据已知乙烯受体基因的序列信息,设计1对简并引物和1对特异引物,对甘蔗叶片基因组DNA进行PCR扩增,获得1个甘蔗乙烯受体基因(Sc-ERS)的片段,其大小为4310 bp,包含1个由5个外显子和4个内含子组成的4219 bp大小的完整编码区.Sc-ERS编码区与玉米乙烯受体ERSI基因(AY359578)、水稻乙烯受体ERS1基因(AY043031)编码区的同源性分别为91.4%、61.6%;推导Sc-ERS编码的蛋白包含636个氨基酸残基,与玉米、水稻乙烯受体基因所编码蛋白的氨基酸同源性分别为94.1%、89.4%.其推导蛋白结构分析结果显示,Sc-ERs编码的蛋白和玉米、水稻ERSI所编码的蛋白相同,在N段保守区含有3个跨膜结构,并由3个跨膜结构、GAF结构、HisKA和HATPase_c组成功能域.核苷酸序列分析和蛋白质结构分析结果表明,Sc-ERS基因属于ERSI基因.